Tujuan IIX adalah membentuk jaringan interkoneksi nasional yang memilikai kemampuan dan fasilitas yang sesuai dengan kebutuhan yang ada, untuk digunakan oleh setiap Penyelenggara Jasa Internet yang memiliki ijin beroperasi di Indonesia. Pada saat ini program IIX tidak mempunyai tanggal berakhirnya program secara keseluruhan, melainkan dibagi atas tahapan-tahapan yang akan dikembangkan secara terus-menerus.

Pada prinsipnya pengelolaan IIX-APJII akan dilakukan oleh personal APJII atau pihak ketiga yang dipilih secara transparan. Dana investasi dan operasional akan dibagi ke seluruh anggota IIX-APJII berdasarkan cost-recovery ditambah tabungan untuk dana pengembangan. Seluruh perputaran uang di program IIX-APJII akan dapat diaudit oleh setiap anggota, sehingga pemanfaatan program untuk kepentingan-kepentingan pihak tertenutu dapat dihindarkan. Menyadari posisi strategis dari program IIX-APJII, pengurus APJII akan mengundang berbagai sponsor untuk memberikan kontribusi teknis peralatan, jasa maupun dana, dengan imbalan publikasi dan imbalan-imbalan lainnya dalam batas kewenangan pengurus APJII.

Program IIX-APJII mengharapkan partisipasi dari berbagai pihak: Seluruh anggota APJII untuk mengalokasikan waktu dan sumber daya di setiap tahapan implementasi. Penyedia perangkat jaringan seperti router, switch, server(routeserver), kabel, tester/analyzer, monitoring software/hardware untuk menyumbangkan peralatan yang dapat dimanfaatkan dalam proses instalasi dan pengoperasian IIX-APJII. Penyedia perangkat dan infrastruktur telekomunikasi seperti Metro/Local-looop dan sejenisnya untuk interkoneksi antar jaringan-jaringan PJI dan jaringan IIX Wilayah. Penyandang dana yang berminat membiayai program dengan tujuan komersial maupun non-komersial (hibah).